Master mention Bio-informatique
Type de diplôme
Master
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Master mention Bio-informatique
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Enseignants responsables de la mention
Gwennaele FICHANT
Jérôme FARINAS
mbioinfo.contact@univ-tlse3.fr
Gwennaele FICHANT
Jérôme FARINAS
mbioinfo.contact@univ-tlse3.fr
Composante
Présentation de la formation
Le master mention Bio-informatique forme des étudiant(e)s sur des capacités multidisciplinaires, biologie, informatique et mathématiques, nécessaires pour œuvrer dans le domaine de la bio-informatique, de la biologie des systèmes et de la génomique environnementale.
A l’issue de cette formation, les étudiants auront acquis l’autonomie nécessaire pour conceptualiser les problèmes liés à l’analyse des données biologiques et pour mettre en place et/ou développer les réponses méthodologiques adaptées pour résoudre la question biologique posée, en maîtrisant :
A l’issue de cette formation, les étudiants auront acquis l’autonomie nécessaire pour conceptualiser les problèmes liés à l’analyse des données biologiques et pour mettre en place et/ou développer les réponses méthodologiques adaptées pour résoudre la question biologique posée, en maîtrisant :
- les connaissances en programmation et gestion des données pour accompagner des projets en biologie,
- les compétences en traitements mathématiques des grands jeux de données pour en extraire les informations pertinentes,
- les démarches pour dégager à partir de différentes sources de données hétérogènes les relations entre objets dans le but d'inférer des réseaux biologiques,
- les démarches d’inférence et de prédiction relatives aux systèmes biologiques / écologiques étudiés.
Ce master propose 2 parcours :
- Bioinformatique et génomique environnementale (BGE) : commun avec la mention Biodiversité, Ecologie et évolution, ce parcours met l'accent sur le traitement et l'intégration des différents types de données Omics, et sur l'inférence et la modélisation dynamique des réseaux de gènes afin de mieux comprendre le comportement dynamique du système biologique dans sa globalité.
- Bioinformatique et biologie des systèmes (BBS) : met l'accent sur le traitement des données génomiques issues de populations naturelles ou de prélèvements environnementaux, la description de leur diversité taxonomique et fonctionnelle, la modélisation des interactions entre les différentes composantes ainsi que sur l'inférence de leur évolution et la prédiction de leur capacité d'adaptation.
Capacité d'accueil globale* d'accès à la mention : 27
- * La capacité globale, c'est quoi ?
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* La capacité d'accueil globale à la mention indique le nombre total de place à pourvoir pour la formation et l'ensemble de ses parcours et des étudiants (étudiants entrants, redoublants, publics de formation continue et étudiants étrangers via Etudes en France). Les capacités indiquées sur la plateforme Parcoursup (places offertes) ne prennent en compte que les étudiants entrants.
Parcours
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Master parcours Bioinformatique et biologie des systèmes (BBS)
Durée de la formation : 2 ansNiveau de sortie : Bac + 5 (Niveau 7)Le parcours BBS est une formation multidisciplinaire en biologie, informatique et mathématiques pour une biologie holistique qui fera face aux défis scientifiques de demain en Biologie et en SantéDécouvrir -
Master parcours Bioinformatique et génomique environnementale (BGE)
Durée de la formation : 2 ansNiveau de sortie : Bac + 5 (Niveau 7)Le parcours BGE forme à la bioinformatique pour des applications croissantes dans les domaines de l'écologie, de l'évolution et de l'environnement pour faire face aux défis liés aux changements globaux.Découvrir
Et après ?
Compétences
- Collecter, intégrer et structurer diverses sources de données biologiques hétérogènes et massives au sein d'un système de base de données pour l'analyse et l'exploitation des résultats dans le cadre d'un projet en sciences du vivant.
- Décrire, structurer et résumer une grande quantité d'informations en mettant en oeuvre des tests et des analyses mathématiques et statistiques appropriés aux traitements de grands jeux de données pour soit aider à la prise de décision, soit proposer ou vérifier des hypothèses dans le cadre de recherches appliquées ou fondamentales
- Concevoir les traitements informatiques adaptés à la résolution de questions biologiques liées à l'analyse de données complexes.
- Intégrer différentes sources de données en dégageant et interprétant en terme biologique les associations entre les différents types de données de manière à inférer des réseaux de relations pour analyser et comprendre des processus biologiques.
- Comprendre le comportement dynamique d'un système ou processus biologique et prédire son comportement dans de nouvelles conditions en représentant les connaissances scientifiques disponibles dans un modèle mathématique et en confrontant les résultats des simulations numériques aux résultats expérimentaux afin d'aider aux développements d'expérimentations plus ciblées.
Fiche RNCP
Fiche RNCP (Commission Nationale de Certification Professionnelle)
Débouchés professionnels
- Recherche académique (CNRS, INRAE, INSERM, CIRAD, IRD, ...)
- Sociétés innovantes de biotechnologies
- Industries pharmaceutiques et cosmétiques
- Firmes semencières, entreprises tournées vers les biotechnologies végétales
- Industrie agroalimentaire
- Organismes de santé publique et de l'environnement
- Plateformes technologiques (ex. Génopoles)
- Laboratoires d'expertise en métagénomique
- Ingénieur d'étude en bioinformatique - niv. cadre